روشهای متداول شامل استفاده از محلولهای شیمیایی (مثل سالیسیلیک اسید یا پودوفیلوکس)، کرایوتراپی (سرما درمانی)، جراحی دستی (کوتاه کردن یا برش زگیل)، و لیزر است. هر کدام مزایا و معایب خاص خود را دارند:
درمانهای موضعی: نیاز به تکرار، تحریک پوست، احتمال بازگشت بالا
کرایوتراپی: دردناک، احتمال تشدید التهاب، اسکار بر جا میگذارد
جراحی سنتی: خونریزی، درد پس از عمل، ریسک عفونت و اسکار
به همین دلیل، انتخاب روشی که کمترین عوارض و بالاترین اثربخشی را داشته باشد، بسیار مهم است.
همانطور که در وب سایت HPV New Zealand آمده است:
Factors that might influence the choice of treatment include size, location and number of warts, changes in the warts, patient preference, the cost of treatment, convenience, possible adverse effects and the health care provider's expertise.

عوامل مؤثر بر انتخاب روش درمان شامل اندازه، محل و تعداد زگیلها، تغییرات در زگیلها، ترجیح بیمار، هزینه درمان، سهولت انجام، عوارض احتمالی و تخصص ارائهدهنده خدمات بهداشتی میباشد.
مکانیزم عملکرد لیزر در درمان زگیل تناسلی
لیزر در درمان زگیل تناسلی با استفاده از انرژی متمرکز نور، به صورت دقیق به بافتهای آلوده آسیب میرساند و سلولهای ویروسی را تخریب میکند. این فرآیند برخلاف روشهای موضعی که ممکن است فقط سطح زگیل را تحت تأثیر قرار دهند، باعث لایهبرداری کنترلشده و هدفمند میشود و باعث حذف کامل ضایعه میگردد.
هیچ آسیبی به بافت سالم اطراف وارد نمیشود زیرا لیزر توانایی تنظیم عمق نفوذ و گستردگی پرتو دارد. در نتیجه دوره بهبود کوتاهتر شده و احتمال عفونت یا جای زخم کاهش مییابد.
علاوه بر حذف زگیل، لیزر موجب تحریک کلاژنسازی و بازسازی پوست میشود که به بازگرداندن سلامت و زیبایی ناحیه درمان کمک میکند. همچنین به علت انعطافپذیری بالای این روش، میتوان زگیلهایی با ابعاد و تعداد مختلف را به دقت درمان کرد.
مزایای لیزر زگیل تناسلی در کلینیک تخصصی
دقت بالا و هدفمند بودن
لیزر قادر است با تمرکز بسیار بالا فقط زگیلها را مورد هدف قرار دهد، بدون آسیبی به بافت سالم اطراف. این موضوع در نواحی حساس تناسلی اهمیت فراوانی دارد و باعث میشود فرآیند درمان به طرز قابل توجهی ایمنتر و بازسازی سریعتر باشد.