برآورد شده‌است که 99 درصد سرطانهای دهانه رحم در زنان ناشی از HPV میباشند . بعضی از گونه های HPV همینطور میتوانند سرطان مقعد و آلت تناسلی مرد , و همینطور سرطان روده را تولید نمایند . خطر ابتلا به سرطان مقعد در مردان همجنسگرا و دوجنسگرا فعال نزدیک به 17 برابر بیشتر از مردانی است که صرفا با زنان ارتباط جنسی دارا هستند . مردان در گیر به HIV ( ویروس نقص ایمنی تن بشر ) هم در معرض خطر ابتلا به‌این سرطان قرار دارا‌هستند . سرطان مقعد می‌تواند با رادیاسون , پرتو درمانی و جراحی معالجه شود . معالجه های مختص به سطح و جایگاه سرطان بستگی دارا هستند – ( تومور چقدر بزرگ است و تا چه حد سرطان توسعه و گسترش یافته است (
عمده سرطان هایی که در پشت گلو یافت میگردند , از جمله در اساس گویش و در لوزه ها , مرتبط با HPV میباشند . در واقع , این ها مرسوم ترین سرطان های مربوط به HPV در مردان است . سالیانه بیشتراز 13 , 000 مورد نو در مردان تشخیص داده می‌شوند .
بقیه گونه های ویروس HPV به تدریج سرطان را در مردان ساخت می نمایند , البته سبب تولید زگیل های تناسلی می‌شوند . .
در حالتی که سهیم معاش شما دارنده سلولهای دهانه رحم ( سرویکس ) غیر نرمال است که در یک تست PAP ( پاپ اسمیر ) تشخیص داده شده‌است , با اهمیت است که وی به صورت منظم معاینات لگن و آزمایشات PAP بیشتر انجام دهد تا در صورت پیدایش سرطان دهانه رحم معالجه را با سریع آغاز نماید .
زگیل تناسلی مردان و زنان , که تحت عنوان condylomata acuminata هم شناخته می شود , رویش برآمدگی های کوچک گوشتی به رنگ صورتی - سپید و به حالت گل کلم است که می‌تواند ناشی از عفونت با ویروس پاپیلوم آدم ( HPV ) باشد . این یکی‌از همه گیرترین عفونت های منتقله از روش تماس جنسی است